Валерий Протопопов родился в 1979 году в селе Намцы. В 2002 году с отличием окончил Хабаровский государственный педагогический университет по специальности «учитель-филолог корейского и английского языков», в 2006 году окончил Дипломатическую академию министерства иностранных дел Российской Федерации (Москва). Имеет диплом с отличием по специальности «экономист в области мировой экономики».
2002-2003 годы — ведущий специалист отдела государственного протокола министерства внешних связей Республики Саха (Якутия);
2003-2006 годы — учеба в дипломатической академии министерства иностранных дел РФ (Москва);
2006-2007 годы — переводчик в компании «BCGI-RUSAL», Гайана, Южная Америка;
2007-2008 годы — главный специалист отдела международного сотрудничества министерства внешних связей Республики Саха (Якутия);
2008-2009 годы — представитель Якутии в секретариате ассоциации региональных администраций стран Северо-Восточной Азии, г. Пхохан, Республика Корея;
2009-2013 годы — проректор по информационным технологиям Якутской государственной сельскохозяйственной академии;
2012-2015 годы — заместитель председателя молодежного правительства Республики Саха (Якутия);
2013-2017 годы — заместитель руководителя отдела международного сотрудничества, руководитель отдела государственного протокола министерства по федеративным отношениям и внешним связям Республики Саха (Якутия);
2017-2018 годы — заместитель руководителя департамента по внешним связям Республики Саха (Якутия);
с 2018 года — начальник департамента внешних связей и реализации инвестиционных проектов окружной администрации города Якутска.